1. Cistrome DB： Cistrome DB是一个全面的转录因子数据库，由哈佛大学刘小乐教授课题组创建。它收录了30451人和26013小鼠的转录因子、组蛋白修饰和染色质可及性样本，是研究ChIPseq和DNaseseq数据的重要资源。

2. PlantTFDB： PlantTFDB专注于植物转录因子，最新版本PlantTFDB 5.0已整合到PlantRegMap中。它提供多种植物的转录因子数据，包括拟南芥、大豆、水稻、杨树、番茄和玉米等。

3. AnimalTFDB： AnimalTFDB是一个涵盖183个物种的转录因子数据库，包含12万个转录因子和8万个转录辅因子的分类、注释和表达数据。用户可以通过转录因子家族或物种进行搜索。

4. JASPAR： JASPAR是一个提供转录因子结合位点的数据库，它包含了跨多个物种的转录因子位置频率矩阵和灵活模型。用户可以搜索、浏览、下载和使用JASPAR数据，用于富集分析、转录因子结合位点提取和基因组追踪等。

5. hTFtarget： hTFtarget是一个专门针对人类转录因子的数据库，收录了659个转录因子的ChIPseq实验样本和699个转录因子的高可信度DNA结合序列。它分为TF、Target、Peak、Coregularion、Coassociation和Prediction六个模块，用户可以查询转录因子的主要调控基因。

6. footprintDB： footprintDB是一个包含最全物种的转录因子和motif的数据库，每月更新。它包含8600个转录因子、12700个motif和27300个DNA结合位点，可以解决实际的科研问题。

7. dbCoRC： dbCoRC是一个全面的交互式核心启动因子数据库，基于H3K27ac ChIPSeq数据的计算分析，包含来自188个人类和50个鼠类样本的CRC模型。

8. TRANSFAC： TRANSFAC是一个经典的转录因子及其靶基因数据库，提供转录因子的详细信息及其靶基因的调控数据。

这些数据库提供了丰富的转录因子信息，适用于不同的研究需求，用户可以根据具体的研究目的选择合适的数据库进行查询和分析。