Mirbase数据库是一个由曼彻斯特大学的研究人员开发的在线miRNA数据库(序列数据库),主要功能包括存储miRNA的序列数据、注释信息和预测基因靶标等。它是目前最全面的miRNA数据库之一,收录了来自200多个物种,接近4万个miRNA的信息。
主要功能1. 存储miRNA序列和注释信息:Mirbase数据库提供了所有已知的miRNA序列及其相关的注释信息。2. 预测基因靶标:数据库中包含了预测的miRNA靶基因信息,帮助研究人员理解基因调控机制。3. 在线查询服务:用户可以使用关键词或序列在线搜索已知的miRNA和靶标信息。4. 数据下载:所有数据都可以从首页的Download page或直接进入FTP站点下载。
使用方法1. 访问Mirbase官网:可以通过浏览器访问Mirbase官网(https://www.mirbase.org/)。2. 搜索特定miRNA:在主页输入目标miRNA的名称或序列,例如“hsalet7a”(hsa代表人类,let7a是miRNA的名称),点击搜索按钮。3. 结果分析:点击搜索结果中的miRNA名称,将进入该miRNA的详细页面,页面包括miRNA的序列、前体序列、基因组位置、家族成员等信息。
Mirbase数据库不断更新,确保数据的准确性和最新性,是研究miRNA的重要资源。
Mirbase数据库:miRNA研究的得力助手
随着生物技术的飞速发展,非编码RNA(ncRNA)的研究逐渐成为热点。其中,miRNA(microRNA)作为一种重要的ncRNA,在基因表达调控、细胞分化和发育过程中发挥着关键作用。Mirbase数据库作为miRNA研究的重要工具,为科研人员提供了丰富的miRNA序列、注释和预测信息。本文将详细介绍Mirbase数据库的功能、使用方法和应用领域。
一、Mirbase数据库简介
Mirbase数据库是由英国Sanger研究所开发的一个在线miRNA数据库,旨在收集、整理和提供全球范围内已知的miRNA序列、注释和预测信息。该数据库自1997年建立以来,已经发展成为miRNA研究领域最为权威和完善的数据库之一。
二、Mirbase数据库的功能
Mirbase数据库具有以下主要功能:
miRNA序列检索:用户可以通过名称、序列、物种等关键词进行miRNA序列检索,快速找到感兴趣的miRNA。
miRNA家族分析:Mirbase数据库将具有相似序列的miRNA归为同一家族,方便用户进行miRNA亚型分析和功能研究。
miRNA靶标预测:Mirbase数据库提供了多种miRNA靶标预测工具,帮助用户预测miRNA的靶基因。
miRNA注释:Mirbase数据库提供了miRNA的详细信息,包括序列、来源、结构、功能等。
miRNA文献检索:Mirbase数据库提供了miRNA相关的文献检索功能,方便用户了解miRNA的最新研究进展。
三、Mirbase数据库的使用方法
以下是Mirbase数据库的基本使用方法:
访问Mirbase数据库官网(http://www.mirbase.org/)。
在搜索框中输入miRNA名称、序列或物种等信息,进行检索。
查看检索结果,点击感兴趣的miRNA进入详细页面。
在详细页面中,可以查看miRNA的序列、来源、结构、功能、靶标等信息。
四、Mirbase数据库的应用领域
Mirbase数据库在以下领域具有广泛的应用:
miRNA功能研究:Mirbase数据库为miRNA功能研究提供了丰富的序列、注释和预测信息,有助于揭示miRNA在基因表达调控、细胞分化和发育过程中的作用。
疾病研究:miRNA在多种疾病的发生、发展和治疗过程中发挥重要作用。Mirbase数据库为疾病研究提供了miRNA序列、注释和预测信息,有助于揭示疾病的发生机制和寻找新的治疗靶点。
药物研发:Mirbase数据库为药物研发提供了miRNA序列、注释和预测信息,有助于发现新的药物靶点和开发新的药物。
Mirbase数据库作为miRNA研究的重要工具,为科研人员提供了丰富的miRNA序列、注释和预测信息。通过使用Mirbase数据库,科研人员可以更好地了解miRNA的生物学特性、功能和应用。随着miRNA研究的不断深入,Mirbase数据库将继续发挥重要作用,为miRNA研究提供有力支持。