拟南芥数据库中最权威和广泛使用的是TAIR（The Arabidopsis Information Resource）。以下是关于TAIR数据库的一些详细信息：

1. 数据库简介： TAIR是由美国斯坦福卡奈基科学研究所维护的拟南芥信息资源中心，提供拟南芥（Arabidopsis thaliana）的遗传学和分子生物学数据。 它是国际上最权威的拟南芥基因组数据库和拟南芥基因组注释系统，提供丰富的数据资源和最新的注释信息。

2. 数据内容： TAIR提供的数据包括完整的基因组序列、基因结构、基因产物信息、基因表达、DNA和种子库、基因组图谱、遗传和物理标记、出版物等。 还包含一些生化途径数据（如AraCyc和PlantCyc）和SNPs、插入、删除和TDNAs的变异数据。

3. 使用工具： TAIR提供多种生物信息学工具，包括搜索、浏览、批量下载、GO富集分析等。 用户可以通过这些工具轻松找到基因的功能、序列、表达量、以及突变体等相关数据。

4. 访问和使用： TAIR网站提供了详细的访问方式和使用指南，国内科研、教学机构可以通过国家科技图书文献中心（NSTL）等途径免费使用。

5. 合作与资源： TAIR与位于俄亥俄州立大学的拟南芥生物资源中心（ABRC）合作，为全球用户提供DNA和突变体种子等研究材料。 TAIR成功整合了数据、工具和研究材料，成为植物研究的“一站式”信息枢纽。

通过以上信息，可以看出TAIR是一个功能强大且资源丰富的拟南芥数据库，非常适合用于拟南芥及相关植物的研究。

探索拟南芥研究的宝库——拟南芥数据库综述

拟南芥（Arabidopsis thaliana）作为植物生物学研究中的模式生物，其基因组、转录组、甲基化组等多组学数据的研究对于揭示植物生长发育、环境适应等生物学过程具有重要意义。随着高通量测序技术的快速发展，大量拟南芥多组学数据被产生并存储在各个数据库中。本文将对几个重要的拟南芥数据库进行综述，以期为研究者提供便捷的数据获取和分析平台。

AtMAD——拟南芥多组学综合数据库

AtMAD（http://www.megabionet.org/atmad）是一个集成了拟南芥基因组、转录组、甲基化组、环境和表型之间关联的公共数据的综合数据库。该数据库由1001 Genomes Consortium和1001 Epigenomes Project提供数据支持，整合了1135个拟南芥天然近交系的基因型数据，以及620个RNA-seq和甲基化数据。AtMAD数据库的构建旨在为研究者提供一个全面、便捷的拟南芥多组学数据资源，有助于揭示基因组-转录组-甲基化组-环境-表型互动网络。

ARS——拟南芥RNA-seq数据库

ARS（Arabidopsis RNA-seq database）是一个整合了超过20,000个拟南芥RNA-seq数据的在线数据库。该数据库由南方科技大学生物系植物与食品研究所翟继先课题组开发，整合了来自GEO、SRA、ENA和DDBJ数据库的RNA-seq数据。ARS数据库提供了一个方便快捷的查询工具，可以对所有文库进行基因表达水平定量和共表达网络分析，并按突变体、处理条件、组织等进行分类。

TAIR——拟南芥基因信息资源

TAIR（The Arabidopsis Information Resource）是一个专门针对拟南芥基因的数据库，提供了拟南芥的基因组图谱、基因序列、结构、表达模式、功能注释以及详尽的代谢途径等信息。在最新版的TAIR数据库中，记录了拟南芥478条lncRNA的信息，为研究者提供了丰富的基因信息资源。

PLncDB——植物lncRNA数据库

PLncDB（Plantlongnon-codingRNAdatabase）是一个目前较为全面的植物lncRNA数据库，收集了EST分析、RepTAS分析、芯片、RNA-seq分析及TAIR中发现的16,227个拟南芥lncRNA的信息。该数据库记载了植物在不同组织、发育阶段、突变体和应激处理条件下这些lncRNA的表达特性，为研究者提供了丰富的lncRNA信息。

PsctH——植物单细胞研究综合数据库

PsctH（Plant Single Cell Hub）是由华中农业大学棉花遗传改良团队开发的植物单细胞综合数据库。该数据库提供了全面准确的不同植物不同组织各种细胞类型的细胞标记资源和分析流程，并分享植物单细胞研究相关的方法和文献。PsctH数据库还提供了一个植物标记基因数据库，以及不同物种不同组织的原始测序数据，便于研究者进行数据分析或分析结果比较。

PCMDB——植物细胞marker数据库

PCMDB（Plant Cell Marker Data Base）是一个植物细胞marker数据库，收录了六种常见模式植物（拟南芥、水稻、玉米、大豆、番茄和烟草）的三种不同类型的细胞标记。该数据库包括实验验证的标记基因、基于Bulk RNA-seq数据的差异表达标记基因以及通过scRNA-seq鉴定的特定细胞间的差异表达基因，为研究者提供了丰富的细胞marker信息。

拟南芥数据库为研究者提供了丰富的拟南芥多组学数据资源，有助于推动植物生物学研究的发展。本文对几个重要的拟南芥数据库进行了综述，旨在为研究者提供便捷的数据获取和分析平台。随着高通量测序技术的不断发展，拟南芥数据库将不断完善，为植物生物学研究提供更加全面、准确的数据支持。